Nat Commun：防腐劑苯甲酸可能通過SIRT2調(diào)控組蛋白賴氨酸苯甲�；�
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文章背景簡介
BACKGROUND INTRODUCTION
基因的染色質(zhì)結構和轉錄活性受組蛋白（或組蛋白標記）中多種蛋白質(zhì)翻譯后修飾（PTM）的調(diào)節(jié)。越來越多的證據(jù)表明：組蛋白修飾狀態(tài)與細胞代謝有關。例如：細胞代謝或腸道微生物群發(fā)酵可產(chǎn)生短鏈脂肪酸，如：巴豆酸鹽，丁酸鹽，α－酮戊二酸鹽和3－羥基丁酸鹽。這些代謝物可以作為生成�；o酶A的前體，用于組蛋白�；�。這些各種不同的�；o酶A提供了一種有趣的可能性——即機體內(nèi)很可能存在一些未報道過的通路，通過細胞或菌群代謝物來調(diào)節(jié)組蛋白修飾從而影響表觀遺傳。
苯甲酰輔酶A是細菌和腸道菌群中大量芳香生長底物降解的中間體。在哺乳動物細胞中，苯甲酰－CoA的可能來源是苯甲酸鈉（SB），它是全世界最常用的防腐劑之一，食品中最大允許濃度高達0．1％。 盡管SB被美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）列為“generally regarded as safe”的化合物，但新興的研究表明，接觸SB可能對消費者造成傷害。此外，如果對患者靜脈注射過量的SB會導致嚴重的并發(fā)癥。這些研究結果表明人類健康風險與SB有關。然而，其中潛在的生物機制仍然是未知的。
芝加哥大學的Huang He等人，從組蛋白標記賴氨酸苯甲�；@一新型修飾著手，發(fā)現(xiàn)了一種新的表觀遺傳機制，這種機制可能是導致SB對人體產(chǎn)生上述不良生理反應的原因之一，這一發(fā)現(xiàn)2018年發(fā)表在了《Nature Communications》雜志（IF2017－2018＝12．353；綜合2區(qū)），題為“Lysine benzoylation is a histone mark regulated by SIRT2”。
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所用到的主要方法
METHODS
1． 蛋白質(zhì)印跡法（Western Blot ， WB）
2． 液相色譜－質(zhì)譜聯(lián)用技術（HPLC－MS／MS）
3． 免疫沉淀（Immunoprecipitation ， IP）
4． 免疫熒光實驗（Immunofluorescence staining）
5． 結合位點分析法（CHIP－seq）
6． 轉錄組測序技術（RNA－seq）
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文章主要內(nèi)容摘要
ABSTRACT
組蛋白修飾可以動態(tài)調(diào)節(jié)染色質(zhì)的結構和功能，與多種生理病理過程密切相關。 本文報道了組蛋白標記－－賴氨酸苯甲�；↘bz）的識別和表征。 本研究從HepG2和RAW細胞中鑒定出了組蛋白上的22個Kbz位點。 苯甲酸鈉（SB）是被FDA批準的藥物并且被廣泛用作化學食品防腐劑，組蛋白Kbz可被苯甲酸鈉通過產(chǎn)生苯甲酰CoA而發(fā)生。 通過ChIP－seq和RNA－seq分析，本研究證明組蛋白Kbz標記與基因表達相關并且具有與組蛋白乙�；煌纳韺W相關性。 此外，研究表明SIRT2，一種NAD ＋依賴性蛋白質(zhì)脫乙�；福隗w外和體內(nèi)都能去除組蛋白Kbz。 因此，本研究揭示了一種具有潛在生理相關性的新型組蛋白修飾，這一發(fā)現(xiàn)表明被用作化學食品防腐劑的苯甲酸可能還具有表觀遺傳修飾調(diào)控等不為人知的功能。
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